BIOS更新で何故MBRが無くなるの?

現在システム開発用のシステムには、Gigabyte社のGA-990XA-UD3という基盤を使っています。最近はBIOSのサイズも大きくなり、昔のようなフロッピー一枚でBIOS更新という訳に行かなくなっていますが、BIOS内に更新機能が搭載されているのでDOS起動ディスクを作る手間が要らないのは便利。

マニュアルにはUSBを認識するのでBIOSのイメージはUSBドライブへ入れることが可能とあるが、購入時に入っていたBIOSでは認識せず、致し方ないのでgrubを入れるために確保してあった/dev/sda1のサブディレクトリへBIOSイメージを入れて更新作業を実行。BIOS更新に問題はなかったが、再起動後にMBRが消えてブートローダーが起動しない。

UbuntuのリカバリーCDでgrubの再構築は容易なものの、BIOS更新でこのような事態に遭遇するのは初めて。